Les organes sexuels des chinchillas sont parfaitement visible dès la naissance, à l'exception des testicules qui ne sont pas apparents chez les jeunes mâles.
La femelle :L'appareil génito-anal femelle se présente d'un seul bloc: le méat urinaire est très proche de l'anus et séparé de lui par unmince plicutané ( attention, le canal de l'urète peut être pris pour un petit pénis).
Le mâle :Al'inverse, chez le mâle, l'appareil génito-anal se présente en deux parties nettement distinctes, séparées par 1 centimetre environ. Le pénis peut-être facilement exposé.